Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPSAP08865 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms