Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms