Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPLP1P05386 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms