Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms