Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3O95983 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3O95983 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3O95983 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3O95983 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD3O95983 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD3O95983 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD3O95983 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD3O95983 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD3O95983 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms