Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms