Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLDN7O95471 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms