Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRATO95237 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRATO95237 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRATO95237 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms