Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPM2O94759 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms