Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms