Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms