Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms