Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB3O43889 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB3O43889 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB3O43889 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms