Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRC1O43663 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRC1O43663 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRC1O43663 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms