Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ3O43525 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms