Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms