Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCAO15360 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCAO15360 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCAO15360 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms