Protein–RNA interactions for Protein: O15353

FOXN1, Forkhead box protein N1, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN1O15353 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN1O15353 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms