Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms