Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASKO14936 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASKO14936 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASKO14936 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms