Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms