Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB9F8W1W9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms