Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms