Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DSR2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DSR2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DSR2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DSR2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DSR2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DSR2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms