Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms