Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms