Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms