Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms