Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms