Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms