Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC162PA2VCL2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC162PA2VCL2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms