Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms