Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH4-201ENST00000543233 3117 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004147.5-201ENST00000581727 536 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS2P4-201ENST00000582696 205 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097374.1-202ENST00000582835 3329 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023855.1-201ENST00000585899 359 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099849.1-201ENST00000603437 466 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010223.1-201ENST00000625092 279 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR486-2-201ENST00000637446 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01835-203ENST00000639800 567 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFB2-201ENST00000366929 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NMT1-201ENST00000258960 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK5-202ENST00000378423 4613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MSC-AS1-201ENST00000457356 4220 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL2-201ENST00000450879 3178 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD18-202ENST00000436147 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A2-202ENST00000379906 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC5-201ENST00000382111 5212 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3B2-203ENST00000535359 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 STK36-201ENST00000295709 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB6-201ENST00000262726 4869 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MRAS-210ENST00000614350 4377 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM5D-210ENST00000541639 5579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF446-205ENST00000596341 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MED23-205ENST00000368068 5233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms