Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CACNB1Q02641 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms