Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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HOXD11P31277 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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HOXD11P31277 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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