Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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