Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM71F2-205ENST00000641605 5749 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRERF1-201ENST00000340840 4174 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RSPH10B2-202ENST00000403107 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL022323.2-201ENST00000623239 3000 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL6A3-204ENST00000392003 3464 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AFAP1L2-201ENST00000304129 3705 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF662-204ENST00000440367 4099 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMTC4-202ENST00000342624 3602 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABCC11-203ENST00000394747 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AKAP1-204ENST00000539273 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TFIP11-217ENST00000619735 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms