Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms