Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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