Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GY48 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GY48 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GY48 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GY48 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms