Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms