Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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