Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms