Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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