Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP25Q9UHP3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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