Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDRG3Q9UGV2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms