Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MGAT4CQ9UBM8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms