Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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