Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms