Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNKQ9P0W0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFNKQ9P0W0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms